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2026-01-19

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  本报北京电(记者吴月)为疾病靶点匹配适配的小分子,是靶向药物研发的关键。面对人体内数以万计的潜在靶点,如何快速筛选苗头化合物?近日,清华大学智能产业研究院教授兰艳艳联合该校生命学院、化学系团队,创新研发了人工智能驱动的超高通量药物虚拟筛选平台DrugCLIP,其筛选速度比传统方法提升百万倍,预测准确率也取得显著突破。

  依托该平台,团队首次完成了人类基因组级别的药物虚拟筛选,为创新药物发现带来新可能。相关研究成果以“深度对比学习实现基因组级别药物虚拟筛选”为题,于北京时间1月9日在线发表于国际学术期刊《科学》。

  兰艳艳介绍,人类基因组编码2万余个蛋白,受传统工具效率等制约,现有蛋白靶点开发只覆盖其中小部分。团队创新将传统的分子对接方法,转化为蛋白口袋与小分子在向量空间中的高效语义检索。基于128核中央处理器和8张图形处理器的计算节点,DrugCLIP可在1天内完成10万亿次蛋白—配体打分,较传统方法提速百万倍。

  速度提升,准确性如何?团队进行了一系列实验。例如,去甲肾上腺素转运体是抑郁症等疾病的重要靶点,DrugCLIP从160万个候选分子中,为该靶点筛选出约100个高评分分子。实验检测显示,其中15个为有效抑制剂,12个分子的结合能力优于当前一种常用抗抑郁药物。

  目前,依托DrugCLIP,团队完成了覆盖约1万个蛋白靶点、2万个蛋白口袋的虚拟筛选项目,分析筛选超过5亿个类药小分子,富集出超过200万个潜在活性分子,构建了目前已知最大规模的蛋白—配体筛选数据库。

  据悉,该数据库已免费面向全球科研社区开放,为基础研究与早期药物发现提供数据支持。筛选服务平台也同步上线,支持对用户上传的靶点和蛋白口袋进行定制化筛选,截至论文发表时,已累计服务1400余名用户完成1.35万余次筛选。

  兰艳艳说,DrugCLIP平台有助于在抗癌、传染病、罕见病等方向上,加速新靶点与首创新药的发现。团队将持续优化引擎性能,拓展支持模态,助力构建更智能、高效、普惠的药物创新生态。

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